В указанной инструкции нет ничего для авторизации в AD!
В ней говорится о создании домена на основе самбы!
В итоге, скорее всего, вы имеете два контроллера домена а посему авторизоваться в этом зоопарке у вас и не получается (точнее домен захватила самба, а никого, кроме рута, в ее списке пользователей нет).
Для авторизации в AD необходимо использовать security = ad, и все из этого вытекающее.