...Сам знаю, что, например, Slackware и Gentoo с SATA дружат, причем довольно неплохо.
"Дружат - не дружат" тут не причем, говорят же, в FC3 в ядре по умолчанию используется новый драйвер sata контроллера. А то что дистрибутивы постарее устанавливаются без проблем, так это значит там и драйвер старый по умолчанию.
И вообще, Slackware до 10.0 не имела поддержки initrd. А так как еще и в ядре не было поддержки sata, то тем, кто желал установить сразу на sata винт, нужно было много чего еще дополнительно сделать.
...А вообще наличие уже этих двух проблем говорит явно не в пользу Линуха.
Ничего явного из этого не вытекает.
Не пробовал FC2...Но почему этого не догадались сделать ни в FC2 ни в FC3 для меня загадка...
FC2 вы даже не пробовали, поэтому "загадка"?