тогда вопрос так поставлю)))
т.е. сделать установку например 7-й версии на установленный дистрибутив путем обновления? а те пакеты которые я ставил отдельно от дистрибутива они будут работать?
Не понимаю зависимости между версией и настройкой yum.
Обновление FC5 до FC7 возможно по схеме -- FC5 -> FC5 (все обновления) -> FC6 (все обновления) -> FC7.
По поводу последней операции я 100% гарантию дать не могу, но с FC5 до FC6 я обновлялся, но не на "боевой системе".
Если Вы ставили пакеты не из дистрибутива (или extras), то возможно потребуется их удаление перед процедурой обновления, сборка из src.rpm и повторная установка.
Кстати, собственные contribs я так же устанавливаю из отдельного репозитория.